Отговор: Правилно е да се пише слято: ракетноядрена (програма). Думата е сложно прилагателно, при което двете основи са в неравноправно отношение (образувано е от съчетание от прилагателно и съществително име: ядрена ракета).
Официален правописен речник (2012), т. 53.13, с. 551.
[...]